【土地资源】  2018年，境内耕地面积7.34万公顷，粮食播种面积3.02万公顷，粮食产量18.26万吨。林地面积23.38万公顷，森林覆盖率60.18%。
【生物资源】 境内海洋生物资源丰富，其中脊椎动物323种，无脊椎动物有306种，其中可供养殖的具有很高经济价值的有虾、蟹、贝、蝇、蛏、牡蛎、花蛤、泥蚶等38种，兴化湾有769种海洋生物，其中浮游生物225种、底栖生物（包括潮间带）544种、经济种200多种，可供养殖的有数十种，湄洲湾渔业品种有350余种，其中鱼类100余种、甲壳动物30余种、藻类10多种。莆田市水产养殖业较为发达，而且品种繁多，贝类主要有海蛎、缢蛏、花蛤等，海藻主要有海带、紫菜、龙须菜、红毛藻、麒麟菜等，以及石斑鱼、鲍鱼、海蜇、海参、青蟹等。境内海域是福建省主要水产养殖区和多种经济鱼虾类产卵，繁殖饵料的优良渔场。
【矿产资源】 境内矿产矿种少，以非金属矿建筑用石料和饰面用石材为主。建筑用石料资源丰富，能满足辖区内各项建设要求。饰面用石材储量较为丰富，主要品种有“华亭青”（石英闪长岩）、“莆禧白”（二长花岗岩）、“月塘黑”（辉长岩）、“平海锈石”（钾长花岗岩）和“大洋红”（凝灰岩）等。金属矿产少，仅有铅、锌、银、钼等有一定的储量且较有远景。能源矿产有地下热水，储量丰富，有开发利用前景。境内海洋矿产资源主要有浅海砂矿资源以及相邻的台湾海峡海底油气资源。全市有浅海砂矿区3处，面积295.21公顷，乌蚯屿凹陷油气区位于乌蚯屿东南方约50公里处，初步勘探油气区面积约6000平方公里，生油地层平均厚度0.8—1公里，石油储量2.7亿吨。境内盐业资源丰富，拥有原盐生产面积1322万平方米，年产食盐13万吨，为福建省三大主要产盐区。
【海洋资源】  境内海域面积4098平方公里，从东至南有兴化湾、平海湾、湄洲湾3大海湾。海岸线总长443公里，其中大陆岸线336公里，海岛267个。湾内有南日岛、乌坵岛、湄洲岛等岛屿，海洋资源丰富。
【港湾资源】  境内海湾一般水深港阔，不淤不冻，湾外岛屿拱卫，两侧有半岛或岬角环抱，形成“口小腹大”的地理形势，避风条件良好，位于台湾海峡中部的湄洲港是“中国少有，世界不多”的天然深水良港，北距福州港126海里，南距厦门港96海里，东距台中港仅72海里，是中国对外开放的重点地带和对台往来的交通中枢，湄洲湾水深港阔，10万吨级船舶可自由进出，水深10米以下的深水岸线长21.4公里。港湾较多，多处可供建1万吨至30万吨码头泊位，湾内水域广阔，泊稳条件较好，底质为粘土粉沙，抓锚力好，避风锚地众多，是建设大型港口的天然港湾。
【滩涂湿地资源】  境内滩涂面积281.18平方公里，而且地势平缓，淹没时间长，受风面小，有利于水产养殖和盐业生产。全市淤泥岸线长177.1公里，占大陆岸线总长的65.21%，拥有海泥土滩涂129.46平方公里和海泥沙土滩涂97.51平方公里，分别占全市滩涂面积的46.04%和34.68%。
【海洋能资源】  境内沿海风能资源丰富，年有效风能338.2千瓦小时/平方米，年有效风速小数2312小数。兴化湾和湄洲湾两大海湾潮汐能，可开发的装机容量360万千瓦，占全省海洋潮能总容量的36%。
【旅游资源】  境内有“世界和平女神”“海上女神”“远东麦加”之称国家旅游度假区、国家4A旅游景区的湄洲岛。有以湖、洞、瀑、石四奇著称，尤以飞瀑为最，素有"九鲤飞瀑天下奇"之美誉，被明代大旅行家徐霞客把它与武夷山、玉华洞并称“福建三绝”4A级旅游风景区九鲤湖。有始建于北宋治平元年(1064年)，世界灌溉工程遗产，著名的古代大型水利工程，全国五大古陂之一，至今仍保存完整并发挥其水利作用，全国重点文物保护单位木兰陂。有福建“四大禅林”的千年古刹广化寺。有曲溪怪洞的“小武夷”的麦斜岩，有山灵水秀、峭壁千刃的菜溪岩，有云际危楼、神奇险峻的天马山，有雄伟磅礴的壶公山，有山奇岩怪的九华山，有飞泉洒雪的九龙谷等，还有莆田工艺美术城、中国古典工艺博览城、瑞云山等国家4A旅游景区。全年接待入境游客46.86万人次，比上年增长4.3%；接待国内旅游人数3347.19万人，增长19.7%；旅游总收入350.97亿元，增长31.9%。