距莆田城区东南约50公里，是莆田市第二大岛，北对湄洲湾北岸经济开发区，与陆地文甲码头相距仅1.82海里。辖境面积15.74平方公里，包括大小岛、屿、礁30多个。镇人民政府驻寨下街，管辖寨下、宫下、高朱、东蔡、莲池、西亭、北埭、港楼、下山、汕尾、后巷11个村民委员会。
       辖地宋、元时属崇福乡新安里；明、清时属七区新安里；民国初期属笏石区，民国16年（1927）划归南日岛务局直属省辖。民国22年归还莆田县，设湄洲乡，下辖6个保。中华人民共和国成立后，属十一区、二十一区、忠门人民公社、湄洲人民公社、湄洲乡、湄洲镇。1988年6月省人民政府批准为对外开放旅游经济区，1989年2月成立湄洲岛旅游经济区管委会，系莆田市人民政府派出机构，直管湄洲镇。2002年2月，莆田县撤销后，湄洲镇隶属秀屿区管辖。但该镇一切的行政事务管理由湄洲岛国家旅游度假区管委会全权负责。