古称“南匿山”，南为无际的大海，面积33.04平方公里，由70个岛屿组成，主岛南日岛，为莆田第一大岛，福建省第三大岛。辖海山、云万、岩下、石盘、山初、万峰、三墩、西高、沙洋、港南、浮叶、后叶、东岱、小日、鳌屿、罗盘、赤山17个村委会，镇人民政府驻海山村南海东路。
       南日岛早在商周时期，就有人类活动。20世纪50年代后，在海山和后坑之间发现乱石山遗址，发现石环、石球、红砂、陶纺轮、各种陶片等136件。宋时隶属奉谷里，明洪武年间，设南日山水寨，派水师和哨船防守，为福建五大水寨之一。清初，实行截界，强迫百姓内迁，南日岛成为郑成功抗清基地之一。清道光、咸丰年间在南日设县丞，1916年划归福清县，1936年收归省管，为特种区。1940年以后，划回莆田县管辖。中华人民共和国成立后，分别属十三区、二十四区、南日区、南日乡，1958年建立南日人民公社，1984年改为南日乡，1994年改称南日镇。2002年8月划归秀屿区管辖。
       岛上山岭相连，有尖山、猪母山、大峤山、九重山等4个山峰较高。有蓄水10万立方米以上的水库5座。新建的19×850千瓦南日风电场已投产发电。境内天然港澳多，主要有西寨、石头盘、云寺、岩下、浮斗、后叶、牛肚、官澳等8处，官澳通往石城和涵江的码头有2个。新建的交通码头有万隆、坑口、浮叶、小日、罗盘、赤山鳌屿等，主要道路有南海东、西路，富康路、惠平街、新南街等。
       岛上主要景点有尖山望远（海山村）、大峤吐烟（东岱村），九重山（港南村）上有薛刚寨、古堡、妈祖宫等，纪念地有“南日岛烈士纪念碑”。

       南日：古名“南匿山”，又名“南日山”，因该岛位于莆田市区的东南方，隐匿茫茫大海中，故名“南匿”。后因方言同音，又取笔划简单，而写成南日。